Инициатива создания Благотворительного фонда по восстановлению Воскресенского Ново-Иерусалимского монастыря принадлежит Президенту Российской Федерации Д. А. Медведеву и Патриарху Московскому и Всея Руси Алексию II. Под их председательством 20 октября 2008 года в Кремле прошло первое заседание Попечительского совета фонда. Председателем Правления фонда был назначен тогда Первый заместитель Председателя Правительства Российской Федерации В.А.Зубков.

Выступая на первом заседании Попечительского совета, Патриарх Московский и Всея Руси Алексий II отметил, что "Ново-Иерусалимский монастырь является жемчужиной монастырской архитектуры", "сокровищницей вселенского православия", созидавшейся "как пространственная икона изображения Святой Земли".

Президент Российской Федерации Д.А.Медведев подчеркнул, что, "восстанавливая такие центры, мы помогаем возрождению наших корней и нравственных ценностей нашего народа, а без этого невозможно решить ни одну крупную задачу, которая сегодня стоит перед нашим государством".

Восстановление Воскресенского Ново-Иерусалимского монастыря - великой национальной святыни и уникального историко-культурного памятника мирового значения - стало крупнейшим совместным проектом государства, Русской Православной церкви и общества, реализованным силами многих тысяч людей и организаций, усилиями всех, кто дорожит историей Отечества, его национальным, культурным и духовным достоянием, величием Православной церкви.