Основная цель экспозиции «Детский музей» - сделать процесс знакомства детей с историей Ново-Иерусалимского монастыря интересным и увлекательным, совместив его с развитием творческих навыков.
Уникальным по характеру является само пространство, в котором расположен Детский музей: небольшие старинные помещения XVIII века с великолепными видами из окон. Музейное игровое действо разворачивается на фоне подлинных кладок и планировки помещений с их нишами-печурами, оконными и дверными проемами, печами и другими деталями, образующими уникальные архитектурные кулисы.
Общая тематическая структура организована путем создания конкретных сюжетов каждого зала, что позволяет выделить особые темы, не свойственные традиционным историческим или художественным музеям, то есть представить детям те действительно уникальные области сохранения и изучения духовного наследия, раскрытие которых свойственно только Музею в Воскресенском Ново-Иерусалимском монастыре и невозможно ни в каком ином месте.
Экспозиция «Детский музей» состоит из нескольких тематических разделов, размещенных в 9 залах.